Utopinis megapolis Zalemas nusidriekęs iki pat dangaus. Be jo horizonte daugiau nieko nesimato. Po juo – bjaurus požeminis pasaulis, vadinamas Geležies miestu, kur kaupiamas metalo laužas ir kitos atliekos. Tarp milžiniškų šiukšlių kalnų gyvena žmonės ir kiborgai. Daktaras Daisukė Ido taiso kiborgus. Kartą, apžiūrinėdamas senų androidų dalis, jis aptinka jaunos kiborgės galvą. Jis sukuria jai naują kūną ir pavadina ją Alita. Paleidus jos sistemą, Alita atrodo nieko neprisimena apie savo praeitį. Vis dėlto tai jos nė kiek netrikdo, kol šalia Ido. Tačiau netrukus ji sužino, kad Ido uždarbiauja papildomai: jis – premijų medžiotojas, dirbantis Geležies miesto vyriausybei. Nepaisydama Ido, Alita nusprendžia irgi tapti premijų medžiotoja, tad dėl to ji prisimena užmirštas kovos technikas. Įgijusi jėgų, Alita ryžtasi kovoti Geležies miesto gatvėse ir už jo ribų, kad prisimintų, kas ji tokia.

Ši mangų serija užbaigta.